Folkhälsomyndigheten kommer att ha samma uppgifter som Statens folkhälsoinstitut och Smittskyddsinstitutet har idag. De båda myndigheterna läggs ned. Dessutom kommer Folkhälsomyndigheten att ta över större delen av Socialstyrelsens arbete kring miljöns påverkan på hälsan samt ansvaret för miljö- och folkhälsorapporteringen.
Folkhälsomyndighetens verksamhet kommer att vara förlagd till både Solna och Östersund.